O Laboratório de Hidrobiologia foi criado em 1995, a partir do Laboratório de Avaliação Ambiental e do legado da Professora Letícia M. Mayr. O nome “Hidrobiologia” é uma homenagem ao Dr. Luiz Lejeune de Oliveira, pioneiro nos estudos sobre a Baía de Guanabara. Nossa missão é estudar a qualidade das águas em diversos ambientes como a Baía de Guanabara, Baía da Ilha Grande, Oceano Atlântico e rios do Brasil.

Outra importante missão é funcionar como uma central analítica ou laboratório multiusuário de análises químicas e microbiológicas de água. Realizamos análises de água para salinidade, pH, oxigênio dissolvido, amônia, nitrito, nitrogênio total, fosfato, fósforo total, silicato, clorofila, Bacterioplâncton autotrófico e heterotrófico & Virioplâncton.