Descrição

O Laboratório de Biotecnologia oferece serviços abrangentes de análise proteômica. Nosso fluxo de trabalho para análise proteômica comparativa abrange uma gama de técnicas e metodologias de última geração projetadas para atender às diversas necessidades de nossos parceiros. O processo começa com a extração de proteínas, utilizando tampão de ureia/tioureia ou métodos de precipitação de ácido tricloroacético (TCA)/acetona. Isso é seguido pela digestão tríptica de proteínas, empregando o método de preparação de amostra auxiliada por filtro (FASP) ou digestão em solução, garantindo um processamento completo e eficiente.

Para aquisição de espectros de massa, utilizamos um nanoACQUITY UPLC acoplado a um instrumento Synapt G2 S i Q-TOF (Waters), operado nos modos positivo e de resolução (modo V). Esta configuração incorpora mobilidade iônica e modo de aquisição independente de dados (DIA) (HDMSE) para capturar espectros de massa abrangentes com alta precisão e detalhes.

O processamento subsequente de espectros de massa, pesquisa de banco de dados e quantificação sem rótulo são realizados usando o software PLGS e ISOQuant, ou Progenesis QI para Proteômica, dependendo dos requisitos específicos da análise. Nossa saída de fluxo de trabalho padrão inclui tabelas detalhadas do Excel listando todas as proteínas e peptídeos identificados, completas com análise de acumulação diferencial com base no teste t e variações de mudança de dobra, fornecendo insights claros e acionáveis.