Análise Proteômica
Identificação em larga escala de proteínas a partir de amostras complexas.
Pesquisador responsável: Prof. Dr. Vanildo Silveira
Descrição
O Laboratório de Biotecnologia oferece serviços e cursos em análise proteômica. Nosso fluxo de trabalho para análise proteômica comparativa abrange uma gama de técnicas e metodologias de última geração projetadas para atender às diversas necessidades de nossos parceiros. O processo começa com a extração de proteínas, utilizando tampão de ureia/tioureia ou métodos de precipitação de ácido tricloroacético (TCA)/acetona. Isso é seguido pela digestão tríptica de proteínas, empregando o método de preparação de amostra auxiliada por filtro (FASP) ou digestão em solução, garantindo um processamento completo e eficiente.
Para aquisição de espectros de massa, utilizamos um nanoACQUITY UPLC acoplado a um instrumento Synapt G2 S i Q-TOF (Waters), operado nos modos positivo e de resolução (modo V). Esta configuração incorpora mobilidade iônica e modo de aquisição independente de dados (DIA) (HDMSE) para capturar espectros de massa abrangentes com alta precisão e detalhes.
O processamento subsequente de espectros de massa, pesquisa de banco de dados e quantificação sem rótulo são realizados usando o software PLGS e ISOQuant, ou Progenesis QI para Proteômica, dependendo dos requisitos específicos da análise. Nossa saída de fluxo de trabalho padrão inclui tabelas detalhadas do Excel listando todas as proteínas e peptídeos identificados, completas com análise de acumulação diferencial com base no teste t e variações de mudança de dobra, fornecendo insights claros e acionáveis.
OBS: Informamos que nossas análises são realizadas com rigor científico e metodológico, mas ressaltamos que NÃO possuímos credenciamento em redes como a REBLAS, nem acreditação ISO, portanto, os resultados não têm validade oficial perante órgãos reguladores.
Valores iniciais para análise proteômica label-free a partir de amostras complexas:
1. DOCENTES UENF PREP/MS: R$ 438,70
2. DOCENTES UENF MS: R$ 173,58
3. PRESTAÇÃO DE SERVIÇO: R$ 1513,97
Detalhamento:
1. DOCENTES UENF PREP/MS: Contempla projetos coordenados pelos pesquisadores da UENF ou usuários externos, em colaboração com pesquisadores UENF em que todas as etapas da análise são realizadas na BIOINT, desde o preparo da amostra até aquisição e processamento dos dados. Os custos das análises incluem exclusivamente os reagentes, insumos e solventes utilizados na análise, descontando-se todos os insumos e recursos aportados pela Universidade na Unidade Multiusuária.
2. DOCENTES UENF MS: Contempla projetos coordenados pelos pesquisadores da UENF ou usuários externos, em colaboração com pesquisadores UENF, em que o responsável domina integralmente os procedimentos, realizando as etapas de forma independente, por Operador HABILITADO. Nessa modalidade, as etapas de preparo das amostras são realizadas na unidade de origem do docente responsável, sendo os custos limitados à aquisição dos dados por espectrometria de massas, descontando-se todos os insumos e recursos aportados pela Universidade na Unidade Multiusuária. OBS: Considera-se operador habilitado aquele usuário UENF reconhecido pela Coordenação da BIOINT, com treinamento certificado pela Waters do Brasil ou que tenha adquirido experiência prática na BIOINT, demonstrando domínio completo dos procedimentos de preparo das amostras e de aquisição por espectrometria de massas. Lista de Docentes habilitados: Profa. Claudete Santa-Catarina (LBCT/UENF); Prof. Felipe Astolpho de Almeira (LQFPP/UENF) e Prof. Vitor Batista Pinto (LBCT/UENF).
3. PRESTAÇÃO DE SERVIÇO: Prestação de serviço pela BIOINT à usuários externos, incluindo preparo de amostras, aquisição por espectrometria de massas e análise inicial dos dados realizada por profissional da unidade.





